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繪制細胞發育路線圖有了新工具 可用于了解干細胞分化路徑

  原題目:繪制細胞發育門路圖有了新對象

  基于拓撲學原理,美國哥倫比亞大學研究青海網站建造公司職員開發了一個新對象,可用來描述細胞發育的多種可能路徑,讓科學家具體認識干細西寧科技資訊胞是怎樣生長成為其他細胞的。相關研究揭橥在1日出書的《天然·生物手藝》雜志上。

  每個生物都始于一個細胞,厥后絡續盤據。在被稱為細胞分解的過程中,細胞會盤據成為特殊的細胞,如心臟細胞、骨骼細胞或腦細胞等。要認識沿著分解路徑發育的細胞表里部線索,科學家能夠對其進行RNA測序。但對某些細胞來說,進行RNA測序結果并不睬想,由于這些細胞平日處于分歧的發育狀況。為認識決這個問題,科學家開發出單細胞RNA測序手藝,但仍必要面臨分歧細胞狀況之間關系的問題。

  為解決這一問題,哥倫比亞大學研究職員開發出一種稱為單細胞拓撲數據闡發(scTDA)的算法。該算法可闡發單個細胞的RNA序列,重修潛在的發育軌跡,并實時捕捉分歧轉錄法式的希望環境。拓撲學是研究外觀和外形之間空間關系的數學范疇,在這一研究中,則被用于確定分歧細胞狀況和該狀況下才活潑的基因之間的接洽。

  研究職員使用scTDA繪制了經誘導成為活動神經元細胞的小鼠干細胞的發育路徑。這一起線圖準確地評釋了這些細胞的發育軌跡——從干細胞起頭,至神經元竣事。通過查看哪些基因在門路圖上的特定叉點附近是活潑的,就可以判定在分歧時間節點指導細胞發育的卵白質。該方式已經用于研究源自小鼠肺、人類胚胎和小鼠腦的干細胞的發育路徑。

  研究職員透露,新方式使他們可以深切認識細胞的潛在命運,認識掌握細胞特性的要害分子轉換,并找到使細胞發育免受負面影響的機會。他們期望以后會有更多發明,終極可以在特定發育階段對個體細胞進行深切闡發。


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